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title: 試してみよう{renv}！
tags:  #r with pharma lab meetup 1  
author: [森岡裕[SASユーザー総会世話人]](https://convert.docswell.com/user/6484025)
site: [Docswell](https://www.docswell.com/)
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description: 試してみよう{renv}！ by 森岡裕[SASユーザー総会世話人]
published: April 05, 26
canonical: https://convert.docswell.com/s/6484025/KY8D1V-2026-04-05-101251
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# Page. 1

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試してみよう{renv}!
R with Pharma Lab #1
中嶋 優一


# Page. 2

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Agenda
1.
2.
3.
4.
5.
WHY: 背景と課題
WHAT: {renv}とは？
HOW: {renv}利用方法
Challenge: {renv}利用における課題
Summary
2


# Page. 3

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WHY: 背景と課題
Rを実務で利用する上で重要なポイント
ART model from MSA Framework (TransCelerate)
Accuracy
Reproducibility
Traceability
“GxP compliant”である
3


# Page. 4

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WHY: 背景と課題
• Open-Source → Communityの形成
• 業界の課題に対して、複数企業/担当者で解決案（Packageなど）を作
成する機会が増えている。一方で
•
•
•
「Packageのバージョンの違い」
「動いていたコードが動かない」
「他環境で再現できない」
のような問題がある。
• 特にReproducibility（再現性）の担保は、承認申請業務においても重要
な課題である。
4


# Page. 5

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WHAT: {renv}とは？
•
•
•
•
{renv} = Rのプロジェクト単位のPackage管理ツール。
最新versionは1.1.8 (as of March 2026)。
プロジェクトごとに独立したライブラリ環境を作成。
Packageのバージョンを固定・管理。
フェーズ
コマンド
役割
初期化
init()
環境設定
追加
install()
Package追加
更新
update()
Package更新
記録
snapshopt()
環境を保存
確認
status()
差分確認
再現
restore()
環境を再現
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# Page. 6

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WHAT: {renv}とは？
• LibraryとRepositoryの違いについて
•
Library: インストールされたPackageを含むディレクトリ（フォルダ）
•
•
library(dplyr) → dplyrのライブラリをロードしているのではなく、dplyrのPackageをロードして
いる。
Repository: CRANの様なPackageのソースとなるもの。その他Posit Public
Package Manager, 組織内GitHub, など
•
install.packages() → リポジトリからPackageを取得し、ライブラリに配置することを意味する。
6


# Page. 7

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HOW: {renv}利用方法
解析環境をsnapshotする
外部の解析環境を再現
7


# Page. 8

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解析環境をsnapshotする
1. 新規Projectを作成する
•
“New Directory” → “New Project” → “Create New
Project“で“Use renv with this project”を選択
•
renv.lockファイル
8


# Page. 9

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解析環境をsnapshotする
2. Project libraryにいくつかのPackageを新規installする
•
> install.packages(c("admiral", "tidyverse"))
9


# Page. 10

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解析環境をsnapshotする
3. >renv::status()により、renv.lockとの
差分を確認する
4. 追加したPackageをsnapshotし、
renv.lockファイルを更新する
•
>renv::snapshot()
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How to use
個人の解析環境をsnapshotする
外部の解析環境を再現
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# Page. 12

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外部の解析環境を再現
• R consortium pilot 3の解析環境を再現
•
手順はADRG Appendix 1 : Pilot 3 Installation and Usageに準ずる
Core Analysis Repository
• adam/: Original CDISC ADaM Pilot data created in SAS used for
comparison
• submission/adam: R generated ADaM datasets
• submission/output: R generated TLFs
• submission/programs: Production and QC programs for ADaMS
• submission/sdtm:Original CDISC SDTM Pilot data created in SAS
• .Rprofile: Project startup file to set up environment,
• renv.lock: Locks in the versions of R packages and version of R
• vignettes/: Markdown files that render TLFs and Datasets for Website
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# Page. 13

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外部の解析環境を再現
1. RStudioにおいて新規Projectの作成, Git RepositoryをClone
•
Create Project → Version Control → Git
2. {renv}のinstall
•
•
> install.packages("remotes")
> remotes::install_version("renv", version = "0.17.0")
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# Page. 14

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/PEXQV4Z1JX.jpg)

外部の解析環境を再現
3. ~rconsortiumpilot3/analysis/adam/p
rogramsの直下にある”renvlock.txt”をProject直下に移動、ファ
イル名を”renv.lock”に変更
4. Sessionをrestartし、renv::init（）を実
行
5. renv::restore()により、lockファイルの
package群を再現させる
6. renv::status()で再現されたpackageと
lockファイル内のpackageを比較する
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# Page. 15

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外部の解析環境を再現
7. {pilot3utils}はzipファイルとして存在し
ているので、package managerからzip
ファイルをinstall
8. adsl.rを実行し、Error無く動くかを確認
•
sdtmへのpathは設定が必要。
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# Page. 16

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Challenge: {renv}利用における課題
restore()失敗の本質
renvの守備範囲の限界
よくある落とし穴
• renv::restore() =
Package install処理
• 環境不整合で簡単に失
敗…
• R version
• OS / system
dependencies
• Binary有無
• 「restoreだけ押す」は
NG → 環境評価が必
要
• 再現性の範囲：
•
Package version
•
R / OS / system
dependencies
• 新R × 古いPackage（
上三角領域）＝不安定
• 完全再現ではない
→ 必要に応じて
Docker 等
• Binaryが存在しない
→ Source install → 失
敗
• lockfileとR versionの不
整合が主因
* RのPackage install形式には2種類あり、①コンパイル済みの Binary形式 / ② 各個人のPCでコンパイル（Rtoolsなど）が必要なSource形式
フが存在する。後者はOS, R versionに依存するため、restoreが失敗する主因となる。
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# Page. 17

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Summary: 承認申請時における{renv}利用の考察
• 解析に関する情報はADRGに記載
1. OS version
2. R version
3. R package version & Description → renv.lockfileと生成AIの活用を!!
•
•
+ 社内で作成されたPackageを提出する場合、Install方法についても説明があった方がよい。
renv.lockファイル自体を提出し、その説明をADRGに含めることも有用。
• FDAではR SubmissionをSupportするため、追加のFormat受け入れを
開始(eCTD Technical Conformance Guide, August 25, 2025）
•
.rds, .rdb, .rdx, .rdata/.rda, .md, .rd, .zip, .html Post by R Consortium
• PMDAはExecutableである必要はないが、CDE（中国当局）は
Executableである必要があるため、DockerなどのSolutionなども検討が
必要 (R Consortium pilot 4)
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# Page. 18

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Summary: まとめ
• {renv}はR package管理ツールである
• Restoreは単なるpackage install処理であり、解析環境との不整合は考
慮していない
• 実務ベストプラクティス
•
•
•
•
restore前に環境確認
freezeするならR versionも固定
長期プロジェクトは定期更新
再現性が重要なら：→ renv + Docker
• {renv}=RENV stands for “Reproducibility, Eventually… Not Very easy”.
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# Page. 19

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最後に…
PharmaSUG Japan 2026
• 現在「演題」（締め切り6/30）とスポンサー募集中です！
• 参加登録は6月上旬を予定しております。参加費はまぁまぁします…
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# Page. 20

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